Laboratoire MAPIEM (UR 4323)

PhD Thesis Title :

Characterization of metabolomic production and physico-chemical properties of marine biofilms

Scientific Productions:

Publications :

2023

• - MEBMB
  Portas Aurélie, Carriot Nathan, Ortalo-Magné Annick, Damblans Guillaume, Thiébaut Maxime, Culioli Gérald, Quillien Nolwenn, Briand Jean-François
  Impact of hydrodynamics on community structure and metabolic production of marine biofouling formed in a highly energetic estuary
  Marine Environmental Research (2023) 192: 106241

2022

• - MEBMB
  Carriot Nathan, Barry-Martinet Raphaëlle, Briand Jean-François, Ortalo-Magné Annick, Culioli Gérald
  Impact of phosphate concentration on the metabolome of biofilms of the marine bacterium Pseudoalteromonas lipolytica
  Metabolomics (2022) 18, 18

2021

• - MEBMB
  Mion Sonia, Carriot Nathan, Lopez Julien, Plener Laure, Ortalo-Magné Annick, Chabrière Eric, Culioli Gérald, Daudé David
  Disrupting quorum sensing alters social interactions in Chromobacterium violaceum
  npj Biofilms and Microbiomes (2021) 7, 40
• - MEBMB
  Carriot Nathan, Paix Benoit, Greff Stéphane, Viguier Bruno, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Integration of LC/MS-based molecular networking and classical phytochemical approach allows in-depth annotation of the metabolome of non-model organisms - The case study of the brown seaweed Taonia atomaria
  Talanta (2021) 225, 121925

2020

• - MEBMB
  Paix Benoît, Carriot Nathan, Barry-Martinet Raphaëlle, Greff Stéphane, Misson Benjamin, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Multi-omics analysis suggests links between the differentiated surface metabolome and epiphytic microbiota along the thallus of a Mediterranean seaweed holobiont.
  Frontiers in Microbiology (2020) 11, 494. doi: 10.3389/fmicb.2020.00494

Conferences and communications :

• - AFF International - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Portas Aurélie, Briand Jean-François, Ortalo-Magné Annick, Culioli Gérald
  LC-MS based untargeted metabolomics combined with ATR-FTIR spectroscopy reveals how hydrodynamics affects the metabolic production of marine biofilms
  19th Annual Conference of the Metabolomics Society, Niagara Falls, Canada, June 2023
• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Portas Aurélie, Briand Jean-François, Ortalo-Magné Annick, Culioli Gérald
  Effet de l’hydrodynamisme sur la production biochimique de biofilms marins
  15e Journées Scientifiques, Toulon, France, Avril 2023
• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Portas Aurélie, Carriot Nathan, Barry-Martinet Raphaëlle, Ortalo-Magné Annick, Hajjoul Houssam, Dormoy Bruno, Culioli Gérald, Quillien Nolwenn, Briand Jean-François
  Impact de l’hydrodynamisme sur la structure de la communauté microbienne et l’expression métabolique des biofilms marins dans un environnement semi-contrôlé
  Colloque Biofouling, Lorient, France, Novembre 2022
• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Portas Aurélie, Briand Jean-François, Ortalo-Magné Annick, Culioli Gérald
  Effet de l’hydrodynamisme sur la production biochimique de biofilms marins
  Colloque Biofouling, Lorient, France, Nov. 2022
• - AFF International - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Portas Aurélie, Carriot Nathan, Quillien Nolwenn, Barry-Martinet Raphaëlle, Ortalo-Magné Annick, Hajjoul Houssam, Dormoy Bruno, Culioli Gérald, Briand Jean-François
  Impact of hydrodynamics on microbial community structure and metabolic expression of semi-controlled biofilms in marine environment
  18th International Symposium on Microbial Ecology, Lausanne, Switzerland, August 2022.
• - AFF National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Barré Abel, Portas Aurélie, Barry-Martinet Raphaëlle, Carriot Nathan, Lenoble Véronique, Ortalo-Magné Annick, Briand Jean-François
  Dans quelle mesure les communautés free-living et particle-attached contribuent-elles à la diversité de biofilms formés sur des microplastiques en polyéthylène en milieu marin ?
  3e Colloque GDR Polymères & Océans, Brest, France, Juin 2022
• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Portas Aurélie, Carriot Nathan, Quillien Nolwenn, Barry-Martinet Raphaëlle, Ortalo-Magné Annick, Hajjoul Houssam, Dormoy Bruno, Culioli Gérald, Briand Jean-François
  Impact de l’hydrodynamisme sur la structure des communautés et l’expression métabolique de biofilms dans la ria d’Etel (Atlantique, Bretagne)
  14e Journées Scientifiques, Toulon, France, Avril 2022
• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Barry-Martinet Raphaëlle, Briand Jean-François, Ortalo-Magné Annick, Culioli Gérald
  Impact de la carence en phosphates sur la production métabolique d’une bactérie marine cultivée en biofilm
  1ères Journées Scientifiques Numériques du Réseau Francophone de Métabolomique et de Fluxomique (RFMF), Perpignan (France), June 2020.

2019

• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Barry-Martinet Raphaëlle, Briand Jean-François, Ortalo-Magné Annick, Culioli Gérald
  Impact de la carence en phosphates sur la production métabolique d’une souche bactérienne marine formant un biofilm
  3ème édition de l’école saisonnale du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique junior (RFMF), Tours (France), November 2019.
• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Paix Benoît, Carriot Nathan, Barry-Martinet Raphaëlle, Greff Stéphane, Misson Benjamin, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  May differentiated surface metabolome along the thalli of the brown seaweed Taonia atomaria shape the epiphytic microbiota?
  Journées de la Société Phycologique de France, Paris (France), November 2019.
• - AFF National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Paix Benoît, Greff Stéphane, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Utilisation de l’approche des réseaux moléculaires pour l’annotation de nouvelles classes de glycérolipides au sein du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria
  MétaSUD 2019 - Journées de métabolomique en Région SUD - Provence Alpes Côte d’Azur, Toulon (France), June 2019.
• - AFF National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Paix Benoît, Othmani Ahlem, Carriot Nathan, Debroas Didier, Greff Stéphane, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Couplage des analyses du métabolome et du microbiome pour comprendre les interactions chimiques saisonnières entre l’algue brune Taonia atomaria et ses communautés bactériennes épiphytes
  MétaSUD 2019 - Journées de métabolomique en Région SUD - Provence Alpes Côte d’Azur, Toulon (France), June 2019.
• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Paix Benoît, Greff Stéphane, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Variabilité zonale du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria: annotation par l’approche des réseaux moléculaires et liens avec le microbiote associé
  MétaSUD 2019 - Journées de métabolomique en Région Sud - Provence Alpes Côte d’Azur, Toulon (France), June 2019.
• - AFF National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Paix Benoît, Greff Stéphane, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Annotation de nouvelles classes de glycérolipides par l’approche des réseaux moléculaires au sein du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria
  12èmes Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF), Clermont-Ferrand (France), May 2019.
• - AFF National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Carriot Nathan, Paix Benoît, Greff Stéphane, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Annotation du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria par l’approche des réseaux moléculaires
  26ème Journée de la Chimie SCF-PACA, Nice (France), April 2019.

2018

• - COM National - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Paix Benoît , Othmani Ahlem, Carriot Nathan, Debroas Didier, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Coupling metabolome and microbiome analyses for deciphering the chemical dialogue between the brown alga Taonia atomaria and its epiphytic bacterial communities
  5èmes Journées du GDR MediatEC, Rennes (France), October 2018.
• - AFF International - Chemistry of Functional Polymers - MEBMB
  Paix Benoît, Othmani Ahlem, Carriot Nathan, Debroas Didier, Briand Jean-François, Culioli Gérald
  Coupling metabolome and microbiome analyses for deciphering the chemical dialogue between the brown alga Taonia atomaria and its epiphytic bacterial communities
  11èmes Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF), Liège (Belgique), May 2018.